jueves, 02 de julio de 2009

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Unidad de Bioinformática y Biología Computacional:

Nombre de la Facultad o Instituto:
Facultad de Ciencias y Filosofía
Nombre del Departamento o Sección
Departamento de Bioquímica, Biología Molecular y Farmacología
Sección de Bioquímica y Biología Molecular
Nombre del Director, Jefe o Coordinador:
Mirko Zimic
Teléfono 3190000 anexo 2604
Fax 4832942
Correo electrónico zimic@upch.edu.pe
Area temática Bioinformática y Biología Computacional
Líneas de investigación

  • Biofísica del ADN y su relación con la evolución molecular
  • Mecanismo de resistencia a pirazinamida en Mycobacterium tuberculosis
  • Diseño de vacunas multiepitópicas de fusión para taenia solium y virus influenza A.
  • Alosterismos en hemoglobina a nivel dimérico
  • Repotenciación de inhibidores de RNA polimerasa bacteriana
  • Rifaximina

Publicaciones (de los últimos 5 años)

  1. DNA thermodynamic pressure: a potential contributor to genome evolution. 2002. Zimic MJ, Guerra D, Arevalo J. Trans R Soc Trop Med Hyg. 96 Suppl 1:S15-20.



  2. Oberhelman RA, Gilman RH, Sheen P, Cordova J, Taylor DN, Zimic M, Meza R, Perez J, LeBron C, Cabrera L, Rodgers FG, Woodward DL, Price LJ. 2003. Campylobacter transmission in a Peruvian shantytown: a longitudinal study using strain typing of campylobacter isolates from chickens and humans in household clusters. J Infect Dis. 15;187(2):260-9.



  3. Patricia Sheen, Cesar Lopez, Melissa Mendez, Jaeson Calla , Lizeth Peña y Mirko Zimic



  4. Aspectos moleculares de la resistencia a pirazinamida en M.tuberculosis: Implicancias para el desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico y terapéutica. Revista Peruana de Neumología - Por publicarse



  5. Tom F Pelly, Carlos Santillan, Robert H Gilman, Lillia Cabrera, Edwin Garcia, Carlos Vidal, Mirko Zimic, David A Moore,Carlton A Evans.Tuberculosis Skin Testing, Anergy and Protein Malnutrition in Peru. International Journal of TB and lung disease - In press.

Premios

  • 1er puesto: Proyectos de Investigación - Sociedad Peruana de Neumología, 2004. "Aspectos moleculares de la resistencia a pirazinamida en M.tuberculosis: Implicancias para el desarrollo de nuevos métodos de diagnóstico y terapéutica"

Equipamiento mayor

  • 1 Servidor Dual processor Xeon 3.6Ghz, 4GB RAM, 250Gb disco duro SATA

  • 1 Servidor Dual processor Xeon 2.4Ghz, 1GB RAM, 70Gb disco duro SCSI

  • 1 Cluster de 8 PCs, Pentium 4, 2.4Ghz, 512MB RAM, 120Gb disco duro

  • Impresora HP 2300D

  • 3 Computadoras Pentium 3, 700Mhz.

  • Software especializado de Bioinformática, Modelamiento Molecular y Bioestadística, entre los que destacan:

    • Insight II

    • Gaussian 03

    • Gromos 96

    • Gromacs

    • TcpLinda

    • Sculpt

    • Yasara

    • Chimera

    • Vega

    • Mathematica 4.1

    • Stata 8.0

    • PAUP

    • Phylip

    • DAMBE

    • Artemis

Palabras claves

Evolución molecular, replicación del ADN, Rifaximina, RNA polimerasa, Hemoglobina, alosterismo, pirazinamida, vacunas multiepitópicas, vacunas taenia solium, vacunas influenza