Los principales objetivos de la Universidad en el Perú son:

• Formar ciudadanos responsables,
• investigación científica y tecnológica;
• conservar, transmitir y renovar la cultura; y
• constituir una instancia de pensamiento crítico e independiente.

En la "sociedad del conocimiento" en que vivimos hoy, la capacidad de crearlo es el secreto del desarrollo sostenible de los países. Este depende de la competencia de sus profesionales, de sus académicos y de sus científicos.

Nuestro gran objetivo institucional para para el período 2008 - 2013,en los que Cayetano Heredia cumplirá medio siglo de existencia, es consolidar la excelencia académica y el nivel internacional de nuestras investigaciones, legado de nuestros fundadores y resultado de nuestro propio esfuerzo cotidiano. Asimismo, nos proponemos asegurar nuestro liderazgo nacional e incorporarnos al núcleo selecto de las universidades de  vanguardia en el mundo.

Nuestro plan tiene tres fuentes de inspiración. Primero, el Plan Estratégico 2005 - 2009 del que hemos tomado sus fortalezas, y corregido sus debilidades; segundo, las recomendaciones del Instituto de Aseguramiento de la Calidad que nos re-acreditó, haciendo de Cayetano Heredia la primera universidad peruana con acreditación internacional con mención en Investigación; y, tercero, los valiosísimos aportes formulados por profesores y estudiantes a lo alrgo de estos años.

Ejes Estratégicos

El nuevo plan reafirma las ideas rectoras (Visión, Misión, Valores heredianos) vigentes, que deben estar presentes en todos nuestros actos, así como en los planes anteriores el énfasis de la gestión fue A la vanguardia de la Ciencia, luego universidad exitosamente Globalizada, este quinquenio nuestra apuesta es por la Calidad Universitaria.

Se definen 4 ejes estratégicos:

• el eje académico, cuyo destino estratégico es
  • la excelencia académica acreditada internacionalmente y
  • la internacionalización de los programas académicos;
• el eje investigación, cuyo destino estratégico es:
  • posicionamiento internacional como universidad que investiga
  • alcanzar un buen nivel de desarrollo en generación de patentes y transferencia tecnológica al sector productivo;
• el eje de gestión institucional y de extensión , cuyo destino es
  • consolidar el modelo de gestión y la imagen en la sociedad como institución seria, confiable, comprometida socialmente, globalizada, en crecimiento y
  • convertirnos en socio estratégico del Estado, la Empresa y la Comunidad en la solución de los problemas sociales y productivos;
• el eje de gestión administrativo - financiero, cuyo destino estratégico es:
  •  la excelencia operativa, bienestar y
  • salud financiera

Se identifican 16 objetivos con sus respectivos indicadores y metas a alcanzar; estos objetivos están distribuidos en las perspectivas: comunidad y usuarios, financiera, procesos internos y aprendizaje y crecimiento. Se desarrollan las iniciativas estratégicas correspondientes, las mismas que incluyen 26 programas,  32 proyectos y 20 políticas.

Este plan estratégico incorpora el concepto de Balanced Scorecard (BSC) como sistema de monitoreo estratégico, y como marco referencial el benchmarking de alcance global.