El Departamento de Microbiología fue creado en 1964 y surgió con la misión de preparar  académicamente en el área de microbiología a los futuros  profesionales de las diferentes carreras, así como de producir conocimientos  y brindar soluciones en base a  la investigación de problemas de salud

Hoy,  43 años después nuestro departamento realiza investigación en  las áreas de parasitología, bacteriología básica y aplicada, virología y biología celular e inmunología y es  una  unidad consolidada, líder en el campo de la docencia y la investigación  y comprometida en un esfuerzo permanente de renovación en concordancia con  los desarrollos científicos a nivel internacional y  las necesidades de nuestro país. 

El Actual departamento de Microbiología recuerda a los Profesores  que han dejado huella y trayectoria como los Investigadores Rafael Acosta,  Juan Arbaiza,  Carlos Carrillo, Bertha Llanos Z., Elba Miranda, Jorge Naranjo,   Leopoldo Ugaz , Augusto Yi,  y otros.